Open Access
Issue
BIO Web of Conferences
Volume 4, 2015
ORIGINS – Studies in Biological and Cultural Evolution
Article Number 00005
Number of page(s) 16
DOI https://doi.org/10.1051/bioconf/20150400005
Published online 24 June 2015
  • R. E. Green, J. Krause, A. W. Briggs, T. Maricic, U. Stenzel, M. Kircher, N. Patterson, H. Li, W. Zhai, M. H. Fritz, N. F. Hansen, E. Y. Durand, A. S. Malaspinas, J. D. Jensen, T. Marques-Bonet, C. Alkan, K. Prufer, M. Meyer, H. A. Burbano, J. M. Good, R. Schultz, A. Aximu-Petri, A. Butthof, B. Hober, B. Hoffner, M. Siegemund, A. Weihmann, C. Nusbaum, E. S. Lander, C. Russ, N. Novod, J. Affourtit, M. Egholm, C. Verna, P. Rudan, D. Brajkovic, Z. Kucan, I. Gusic, V. B. Doronichev, L. V. Golovanova, C. Lalueza-Fox, M. de la Rasilla, J. Fortea, A. Rosas, R. W. Schmitz, P. L. Johnson, E. E. Eichler, D. Falush, E. Birney, J. C. Mullikin, M. Slatkin, R. Nielsen, J. Kelso, M. Lachmann, D. Reich, S. Paabo, Science 328, 710–722 (2010) [CrossRef] [PubMed]
  • M. Meyer, M. Kircher, M. T. Gansauge, H. Li, F. Racimo, S. Mallick, J. G. Schraiber, F. Jay, K. Prufer, C. de Filippo, P. H. Sudmant, C. Alkan, Q. Fu, R. Do, N. Rohland, A. Tandon, M. Siebauer, R. E. Green, K. Bryc, A. W. Briggs, U. Stenzel, J. Dabney, J. Shendure, J. Kitzman, M. F. Hammer, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, N. Patterson, A. M. Andres, E. E. Eichler, M. Slatkin, D. Reich, J. Kelso, S. Paabo, Science 338, 222–226 (2012) [CrossRef] [PubMed]
  • K. Prufer, F. Racimo, N. Patterson, F. Jay, S. Sankararaman, S. Sawyer, A. Heinze, G. Renaud, P. H. Sudmant, C. de Filippo, H. Li, S. Mallick, M. Dannemann, Q. Fu, M. Kircher, M. Kuhlwilm, M. Lachmann, M. Meyer, M. Ongyerth, M. Siebauer, C. Theunert, A. Tandon, P. Moorjani, J. Pickrell, J. C. Mullikin, S. H. Vohr, R. E. Green, I. Hellmann, P. L. Johnson, H. Blanche, H. Cann, J. O. Kitzman, J. Shendure, E. E. Eichler, E. S. Lein, T. E. Bakken, L. V. Golovanova, V. B. Doronichev, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, B. Viola, M. Slatkin, D. Reich, J. Kelso, S. Paabo, Nature 505, 43–49 (2014) [CrossRef] [PubMed]
  • D. Reich, R. E. Green, M. Kircher, J. Krause, N. Patterson, E. Y. Durand, B. Viola, A. W. Briggs, U. Stenzel, P. L. Johnson, T. Maricic, J. M. Good, T. Marques-Bonet, C. Alkan, Q. Fu, S. Mallick, H. Li, M. Meyer, E. E. Eichler, M. Stoneking, M. Richards, S. Talamo, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, J. J. Hublin, J. Kelso, M. Slatkin, S. Paabo, Nature 468, 1053–1060 (2010) [CrossRef] [PubMed]
  • A. W. Briggs, J. M. Good, R. E. Green, J. Krause, T. Maricic, U. Stenzel, C. Lalueza-Fox, P. Rudan, D. Brajkovic, Z. Kucan, I. Gusic, R. Schmitz, V. B. Doronichev, L. V. Golovanova, M. de la Rasilla, J. Fortea, A. Rosas, S. Paabo, Science 325, 318–321 (2009) [CrossRef] [PubMed]
  • S. S. Ajay, S. C. Parker, H. O. Abaan, K. V. Fajardo, E. H. Margulies, Genome Res 21, 1498–1505 (2011) [CrossRef] [PubMed]
  • H. A. Burbano, E. Hodges, R. E. Green, A. W. Briggs, J. Krause, M. Meyer, J. M. Good, T. Maricic, P. L. Johnson, Z. Xuan, M. Rooks, A. Bhattacharjee, L. Brizuela, F. W. Albert, M. de la Rasilla, J. Fortea, A. Rosas, M. Lachmann, G. J. Hannon, S. Paabo, Science 328, 723–725 (2010) [CrossRef] [PubMed]
  • T. Maricic, M. Whitten, S. Paabo, PLoS one 5, e14004 (2010) [CrossRef] [PubMed]
  • M. L. Carpenter, J. D. Buenrostro, C. Valdiosera, H. Schroeder, M. E. Allentoft, M. Sikora, M. Rasmussen, S. Gravel, S. Guillen, G. Nekhrizov, K. Leshtakov, D. Dimitrova, N. Theodossiev, D. Pettener, D. Luiselli, K. Sandoval, A. Moreno-Estrada, Y. Li, J. Wang, M. T. Gilbert, E. Willerslev, W. J. Greenleaf, C. D. Bustamante, Am J Hum Genet 93, 852–864 (2013) [CrossRef] [PubMed]
  • J. M. Enk, A. M. Devault, M. Kuch, Y. E. Murgha, J. M. Rouillard, H. N. Poinar, Mol Biol Evol 31, 1292–1294 (2014) [CrossRef] [PubMed]
  • J. Krause, Q. Fu, J. M. Good, B. Viola, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, S. Paabo, Nature 464, 894–897 (2010) [CrossRef] [PubMed]
  • E. A. Bennett, D. Massilani, G. Lizzo, J. Daligault, E. M. Geigl, T. Grange, BioTechniques 56, 289–290, 292-286, 298 (2014)
  • A. Kong, M. L. Frigge, G. Masson, S. Besenbacher, P. Sulem, G. Magnusson, S. A. Gudjonsson, A. Sigurdsson, A. Jonasdottir, A. Jonasdottir, W. S. Wong, G. Sigurdsson, G. B. Walters, S. Steinberg, H. Helgason, G. Thorleifsson, D. F. Gudbjartsson, A. Helgason, O. T. Magnusson, U. Thorsteinsdottir, K. Stefansson, Nature 488, 471–475 (2012) [CrossRef] [PubMed]
  • J. C. Roach, G. Glusman, A. F. Smit, C. D. Huff, R. Hubley, P. T. Shannon, L. Rowen, K. P. Pant, N. Goodman, M. Bamshad, J. Shendure, R. Drmanac, L. B. Jorde, L. Hood, D. J. Galas, Science 328, 636–639 (2010) [CrossRef] [PubMed]
  • S. Castellano, G. Parra, F. A. Sanchez-Quinto, F. Racimo, M. Kuhlwilm, M. Kircher, S. Sawyer, Q. Fu, A. Heinze, B. Nickel, J. Dabney, M. Siebauer, L. White, H. A. Burbano, G. Renaud, U. Stenzel, C. Lalueza-Fox, M. de la Rasilla, A. Rosas, P. Rudan, D. Brajkovic, Z. Kucan, I. Gusic, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, B. Viola, M. Meyer, J. Kelso, A. M. Andres, S. Paabo, Proc Natl Acad Sci USA 111, 6666–6671 (2014) [CrossRef]
  • D. L. Stern, V. Orgogozo, Evolution 62, 2155–2177 (2008) [CrossRef] [PubMed]
  • J. Krause, C. Lalueza-Fox, L. Orlando, W. Enard, R. E. Green, H. A. Burbano, J.-J. Hublin, C. Hänni, J. Fortea, M. de la Rasilla, J. Bertranpetit, A. Rosas, S. Pääbo, Current Biology 17, 1908–1912 (2007) [CrossRef]
  • W. Enard, S. Gehre, K. Hammerschmidt, S. M. Holter, T. Blass, M. Somel, M. K. Bruckner, C. Schreiweis, C. Winter, R. Sohr, L. Becker, V. Wiebe, B. Nickel, T. Giger, U. Muller, M. Groszer, T. Adler, A. Aguilar, I. Bolle, J. Calzada-Wack, C. Dalke, N. Ehrhardt, J. Favor, H. Fuchs, V. Gailus-Durner, W. Hans, G. Holzlwimmer, A. Javaheri, S. Kalaydjiev, M. Kallnik, E. Kling, S. Kunder, I. Mossbrugger, B. Naton, I. Racz, B. Rathkolb, J. Rozman, A. Schrewe, D. H. Busch, J. Graw, B. Ivandic, M. Klingenspor, T. Klopstock, M. Ollert, L. Quintanilla-Martinez, H. Schulz, E. Wolf, W. Wurst, A. Zimmer, S. E. Fisher, R. Morgenstern, T. Arendt, M. H. de Angelis, J. Fischer, J. Schwarz, S. Paabo, Cell 137, 961–971 (2009) [CrossRef]
  • T. Maricic, V. Gunther, O. Georgiev, S. Gehre, M. Curlin, C. Schreiweis, R. Naumann, H. A. Burbano, M. Meyer, C. Lalueza-Fox, M. de la Rasilla, A. Rosas, S. Gajovic, J. Kelso, W. Enard, W. Schaffner, S. Paabo, Mol Biol Evol 30, 844–852 (2013) [CrossRef] [PubMed]
  • C. B. Stringer, P. Andrews, Science 239, 1263–1268 (1988) [CrossRef] [PubMed]
  • C. Stringer, Nature 405, 24–25, 27 (2000) [CrossRef] [PubMed]
  • R. L. Cann, M. Stoneking, A. C. Wilson, Nature 325, 31–36 (1987) [CrossRef] [PubMed]
  • F. R. Santos, N. O. Bianchi, S. D. Pena, Genome Res 6, 601–611 (1996) [CrossRef] [PubMed]
  • R. Thomson, J. K. Pritchard, P. Shen, P. J. Oefner, M. W. Feldman, Proc Natl Acad Sci USA 97, 7360–7365 (2000) [CrossRef]
  • M. H. Wolpoff, J. N. Spuhler, F. H. Smith, J. Radovcic, G. Pope, D. W. Frayer, R. Eckhardt, G. Clark, Science 241, 772–774 (1988) [CrossRef] [PubMed]
  • S. C. Schuster, W. Miller, A. Ratan, L. P. Tomsho, B. Giardine, L. R. Kasson, R. S. Harris, D. C. Petersen, F. Zhao, J. Qi, C. Alkan, J. M. Kidd, Y. Sun, D. I. Drautz, P. Bouffard, D. M. Muzny, J. G. Reid, L. V. Nazareth, Q. Wang, R. Burhans, C. Riemer, N. E. Wittekindt, P. Moorjani, E. A. Tindall, C. G. Danko, W. S. Teo, A. M. Buboltz, Z. Zhang, Q. Ma, A. Oosthuysen, A. W. Steenkamp, H. Oostuisen, P. Venter, J. Gajewski, Y. Zhang, B. F. Pugh, K. D. Makova, A. Nekrutenko, E. R. Mardis, N. Patterson, T. H. Pringle, F. Chiaromonte, J. C. Mullikin, E. E. Eichler, R. C. Hardison, R. A. Gibbs, T. T. Harkins, V. M. Hayes, Nature 463, 943–947 (2010) [CrossRef] [PubMed]
  • A. Templeton, Nature 416, 45–51 (2002) [CrossRef] [PubMed]
  • C. Duarte, J. Mauricio, P. B. Pettitt, P. Souto, E. Trinkaus, H. van der Plicht, J. Zilhao, Proc Natl Acad Sci USA 96, 7604–7609 (1999) [CrossRef]
  • E. Trinkaus, Proc Natl Acad Sci USA 104, 7367–7372 (2007) [CrossRef]
  • S. Sankararaman, S. Mallick, M. Dannemann, K. Prufer, J. Kelso, S. Paabo, N. Patterson, D. Reich, Nature 507, 354–357 (2014) [CrossRef] [PubMed]
  • S. Sankararaman, N. Patterson, H. Li, S. Paabo, D. Reich, PLoS Genet 8, e1002947 (2012) [CrossRef] [PubMed]
  • J. D. Wall, M. A. Yang, F. Jay, S. K. Kim, E. Y. Durand, S. Stevison, C. Gignoux, A. Woerner, M. F. Hammer, M. Slatkin, Genetics 194, 199–209 (2013) [CrossRef] [PubMed]
  • P. Moorjani, N. Patterson, J. N. Hirschhorn, A. Keinan, L. Hao, G. Atzmon, E. Burns, H. Ostrer, A. L. Price, D. Reich, PLoS Genet 7, e1001373 (2011) [CrossRef] [PubMed]
  • S. A. Tishkoff, F. A. Reed, F. R. Friedlaender, C. Ehret, A. Ranciaro, A. Froment, J. B. Hirbo, A. A. Awomoyi, J. M. Bodo, O. Doumbo, M. Ibrahim, A. T. Juma, M. J. Kotze, G. Lema, J. H. Moore, H. Mortensen, T. B. Nyambo, S. A. Omar, K. Powell, G. S. Pretorius, M. W. Smith, M. A. Thera, C. Wambebe, J. L. Weber, S. M. Williams, Science 324, 1035–1044 (2009) [CrossRef] [PubMed]
  • B. Vernot, J. M. Akey, Science 343, 1017–1021 (2014) [CrossRef] [PubMed]
  • P. Skoglund, M. Jakobsson, Proc Natl Acad Sci USA 108, 18301–18306 (2011) [CrossRef]
  • M. Currat, L. Excoffier, Proc Natl Acad Sci USA 108, 15129–15134 (2011) [CrossRef]
  • Q. Fu, M. Meyer, X. Gao, U. Stenzel, H. A. Burbano, J. Kelso, S. Paabo, Proc Natl Acad Sci USA 110, 2223–2227 (2013) [CrossRef]
  • Q. Fu, H. Li, P. Moorjani, F. Jay, S. M. Slepchenko, A. A. Bondarev, P. L. Johnson, A. Aximu-Petri, K. Prufer, C. de Filippo, M. Meyer, N. Zwyns, D. C. Salazar-Garcia, Y. V. Kuzmin, S. G. Keates, P. A. Kosintsev, D. I. Razhev, M. P. Richards, N. V. Peristov, M. Lachmann, K. Douka, T. F. Higham, M. Slatkin, J. J. Hublin, D. Reich, J. Kelso, T. B. Viola, S. Paabo, Nature 514, 445–449 (2014) [CrossRef] [PubMed]
  • D. Reich, N. Patterson, M. Kircher, F. Delfin, M. R. Nandineni, I. Pugach, A. M. Ko, Y. C. Ko, T. A. Jinam, M. E. Phipps, N. Saitou, A. Wollstein, M. Kayser, S. Paabo, M. Stoneking, Am J Hum Genet 89, 516–528 (2011) [CrossRef] [PubMed]
  • M. Rasmussen, Y. Li, S. Lindgreen, J. S. Pedersen, A. Albrechtsen, I. Moltke, M. Metspalu, E. Metspalu, T. Kivisild, R. Gupta, M. Bertalan, K. Nielsen, M. T. Gilbert, Y. Wang, M. Raghavan, P. F. Campos, H. M. Kamp, A. S. Wilson, A. Gledhill, S. Tridico, M. Bunce, E. D. Lorenzen, J. Binladen, X. Guo, J. Zhao, X. Zhang, H. Zhang, Z. Li, M. Chen, L. Orlando, K. Kristiansen, M. Bak, N. Tommerup, C. Bendixen, T. L. Pierre, B. Gronnow, M. Meldgaard, C. Andreasen, S. A. Fedorova, L. P. Osipova, T. F. Higham, C. B. Ramsey, T. V. Hansen, F. C. Nielsen, M. H. Crawford, S. Brunak, T. Sicheritz-Ponten, R. Villems, R. Nielsen, A. Krogh, J. Wang, E. Willerslev, Nature 463, 757–762 (2010) [CrossRef] [PubMed]
  • L. Abi-Rached, M. J. Jobin, S. Kulkarni, A. McWhinnie, K. Dalva, L. Gragert, F. Babrzadeh, B. Gharizadeh, M. Luo, F. A. Plummer, J. Kimani, M. Carrington, D. Middleton, R. Rajalingam, M. Beksac, S. G. Marsh, M. Maiers, L. A. Guethlein, S. Tavoularis, A. M. Little, R. E. Green, P. J. Norman, P. Parham, Science 334, 89–94 (2011) [CrossRef] [PubMed]
  • E. Huerta-Sanchez, X. Jin, Asan, Z. Bianba, B. M. Peter, N. Vinckenbosch, Y. Liang, X. Yi, M. He, M. Somel, P. Ni, B. Wang, X. Ou, Huasang, J. Luosang, Z. X. Cuo, K. Li, G. Gao, Y. Yin, W. Wang, X. Zhang, X. Xu, H. Yang, Y. Li, J. Wang, R. Nielsen, Nature 512, 194–197 (2014) [CrossRef] [PubMed]
  • S. T. D. Consortium, A. L. Williams, S. B. Jacobs, H. Moreno-Macias, A. Huerta-Chagoya, C. Churchhouse, C. Marquez-Luna, H. Garcia-Ortiz, M. J. Gomez-Vazquez, N. P. Burtt, C. A. Aguilar-Salinas, C. Gonzalez-Villalpando, J. C. Florez, L. Orozco, C. A. Haiman, T. Tusie-Luna, D. Altshuler, Nature 506, 97–101 (2014) [PubMed]
  • F. L. Mendez, T. Krahn, B. Schrack, A. M. Krahn, K. R. Veeramah, A. E. Woerner, F. L. Fomine, N. Bradman, M. G. Thomas, T. M. Karafet, M. F. Hammer, Am J Hum Genet 92, 454–459 (2013) [CrossRef] [PubMed]
  • E. Elhaik, T. V. Tatarinova, A. A. Klyosov, D. Graur, Eur J Hum Genet (2014)
  • K. Harvati, C. Stringer, R. Grun, M. Aubert, P. Allsworth-Jones, C. A. Folorunso, PLoS one 6, e24024 (2011) [CrossRef] [PubMed]
  • J. Lachance, B. Vernot, C. C. Elbers, B. Ferwerda, A. Froment, J. M. Bodo, G. Lema, W. Fu, T. B. Nyambo, T. R. Rebbeck, K. Zhang, J. M. Akey, S. A. Tishkoff, Cell 150, 457–469 (2012) [CrossRef]
  • M. Meyer, Q. Fu, A. Aximu-Petri, I. Glocke, B. Nickel, J. L. Arsuaga, I. Martinez, A. Gracia, J. M. de Castro, E. Carbonell, S. Paabo, Nature 505, 403–406 (2014) [CrossRef] [PubMed]
  • A. R. Wallace, Transactions of the Linnean Society of London 25, 1–71 (1865) [CrossRef]
  • E. Mayr, Science 141, 765 (1963) [CrossRef] [PubMed]
  • K. de Queiroz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 Suppl 1, 6600–6607 (2005) [CrossRef]
  • K. de Queiroz, Syst. Biol. 56, 879–886 (2007) [CrossRef] [PubMed]

Current usage metrics show cumulative count of Article Views (full-text article views including HTML views, PDF and ePub downloads, according to the available data) and Abstracts Views on Vision4Press platform.

Data correspond to usage on the plateform after 2015. The current usage metrics is available 48-96 hours after online publication and is updated daily on week days.

Initial download of the metrics may take a while.