Open Access
Issue
BIO Web of Conferences
Volume 4, 2015
ORIGINS – Studies in Biological and Cultural Evolution
Article Number 00005
Number of page(s) 16
DOI https://doi.org/10.1051/bioconf/20150400005
Published online 24 June 2015
  • R. E. Green, J. Krause, A. W. Briggs, T. Maricic, U. Stenzel, M. Kircher, N. Patterson, H. Li, W. Zhai, M. H. Fritz, N. F. Hansen, E. Y. Durand, A. S. Malaspinas, J. D. Jensen, T. Marques-Bonet, C. Alkan, K. Prufer, M. Meyer, H. A. Burbano, J. M. Good, R. Schultz, A. Aximu-Petri, A. Butthof, B. Hober, B. Hoffner, M. Siegemund, A. Weihmann, C. Nusbaum, E. S. Lander, C. Russ, N. Novod, J. Affourtit, M. Egholm, C. Verna, P. Rudan, D. Brajkovic, Z. Kucan, I. Gusic, V. B. Doronichev, L. V. Golovanova, C. Lalueza-Fox, M. de la Rasilla, J. Fortea, A. Rosas, R. W. Schmitz, P. L. Johnson, E. E. Eichler, D. Falush, E. Birney, J. C. Mullikin, M. Slatkin, R. Nielsen, J. Kelso, M. Lachmann, D. Reich, S. Paabo, Science 328, 710–722 (2010) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • M. Meyer, M. Kircher, M. T. Gansauge, H. Li, F. Racimo, S. Mallick, J. G. Schraiber, F. Jay, K. Prufer, C. de Filippo, P. H. Sudmant, C. Alkan, Q. Fu, R. Do, N. Rohland, A. Tandon, M. Siebauer, R. E. Green, K. Bryc, A. W. Briggs, U. Stenzel, J. Dabney, J. Shendure, J. Kitzman, M. F. Hammer, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, N. Patterson, A. M. Andres, E. E. Eichler, M. Slatkin, D. Reich, J. Kelso, S. Paabo, Science 338, 222–226 (2012) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • K. Prufer, F. Racimo, N. Patterson, F. Jay, S. Sankararaman, S. Sawyer, A. Heinze, G. Renaud, P. H. Sudmant, C. de Filippo, H. Li, S. Mallick, M. Dannemann, Q. Fu, M. Kircher, M. Kuhlwilm, M. Lachmann, M. Meyer, M. Ongyerth, M. Siebauer, C. Theunert, A. Tandon, P. Moorjani, J. Pickrell, J. C. Mullikin, S. H. Vohr, R. E. Green, I. Hellmann, P. L. Johnson, H. Blanche, H. Cann, J. O. Kitzman, J. Shendure, E. E. Eichler, E. S. Lein, T. E. Bakken, L. V. Golovanova, V. B. Doronichev, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, B. Viola, M. Slatkin, D. Reich, J. Kelso, S. Paabo, Nature 505, 43–49 (2014) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • D. Reich, R. E. Green, M. Kircher, J. Krause, N. Patterson, E. Y. Durand, B. Viola, A. W. Briggs, U. Stenzel, P. L. Johnson, T. Maricic, J. M. Good, T. Marques-Bonet, C. Alkan, Q. Fu, S. Mallick, H. Li, M. Meyer, E. E. Eichler, M. Stoneking, M. Richards, S. Talamo, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, J. J. Hublin, J. Kelso, M. Slatkin, S. Paabo, Nature 468, 1053–1060 (2010) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • A. W. Briggs, J. M. Good, R. E. Green, J. Krause, T. Maricic, U. Stenzel, C. Lalueza-Fox, P. Rudan, D. Brajkovic, Z. Kucan, I. Gusic, R. Schmitz, V. B. Doronichev, L. V. Golovanova, M. de la Rasilla, J. Fortea, A. Rosas, S. Paabo, Science 325, 318–321 (2009) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • S. S. Ajay, S. C. Parker, H. O. Abaan, K. V. Fajardo, E. H. Margulies, Genome Res 21, 1498–1505 (2011) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • H. A. Burbano, E. Hodges, R. E. Green, A. W. Briggs, J. Krause, M. Meyer, J. M. Good, T. Maricic, P. L. Johnson, Z. Xuan, M. Rooks, A. Bhattacharjee, L. Brizuela, F. W. Albert, M. de la Rasilla, J. Fortea, A. Rosas, M. Lachmann, G. J. Hannon, S. Paabo, Science 328, 723–725 (2010) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • T. Maricic, M. Whitten, S. Paabo, PLoS one 5, e14004 (2010) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • M. L. Carpenter, J. D. Buenrostro, C. Valdiosera, H. Schroeder, M. E. Allentoft, M. Sikora, M. Rasmussen, S. Gravel, S. Guillen, G. Nekhrizov, K. Leshtakov, D. Dimitrova, N. Theodossiev, D. Pettener, D. Luiselli, K. Sandoval, A. Moreno-Estrada, Y. Li, J. Wang, M. T. Gilbert, E. Willerslev, W. J. Greenleaf, C. D. Bustamante, Am J Hum Genet 93, 852–864 (2013) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • J. M. Enk, A. M. Devault, M. Kuch, Y. E. Murgha, J. M. Rouillard, H. N. Poinar, Mol Biol Evol 31, 1292–1294 (2014) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • J. Krause, Q. Fu, J. M. Good, B. Viola, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, S. Paabo, Nature 464, 894–897 (2010) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • E. A. Bennett, D. Massilani, G. Lizzo, J. Daligault, E. M. Geigl, T. Grange, BioTechniques 56, 289–290, 292-286, 298 (2014) [Google Scholar]
  • A. Kong, M. L. Frigge, G. Masson, S. Besenbacher, P. Sulem, G. Magnusson, S. A. Gudjonsson, A. Sigurdsson, A. Jonasdottir, A. Jonasdottir, W. S. Wong, G. Sigurdsson, G. B. Walters, S. Steinberg, H. Helgason, G. Thorleifsson, D. F. Gudbjartsson, A. Helgason, O. T. Magnusson, U. Thorsteinsdottir, K. Stefansson, Nature 488, 471–475 (2012) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • J. C. Roach, G. Glusman, A. F. Smit, C. D. Huff, R. Hubley, P. T. Shannon, L. Rowen, K. P. Pant, N. Goodman, M. Bamshad, J. Shendure, R. Drmanac, L. B. Jorde, L. Hood, D. J. Galas, Science 328, 636–639 (2010) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • S. Castellano, G. Parra, F. A. Sanchez-Quinto, F. Racimo, M. Kuhlwilm, M. Kircher, S. Sawyer, Q. Fu, A. Heinze, B. Nickel, J. Dabney, M. Siebauer, L. White, H. A. Burbano, G. Renaud, U. Stenzel, C. Lalueza-Fox, M. de la Rasilla, A. Rosas, P. Rudan, D. Brajkovic, Z. Kucan, I. Gusic, M. V. Shunkov, A. P. Derevianko, B. Viola, M. Meyer, J. Kelso, A. M. Andres, S. Paabo, Proc Natl Acad Sci USA 111, 6666–6671 (2014) [CrossRef] [Google Scholar]
  • D. L. Stern, V. Orgogozo, Evolution 62, 2155–2177 (2008) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • J. Krause, C. Lalueza-Fox, L. Orlando, W. Enard, R. E. Green, H. A. Burbano, J.-J. Hublin, C. Hänni, J. Fortea, M. de la Rasilla, J. Bertranpetit, A. Rosas, S. Pääbo, Current Biology 17, 1908–1912 (2007) [CrossRef] [Google Scholar]
  • W. Enard, S. Gehre, K. Hammerschmidt, S. M. Holter, T. Blass, M. Somel, M. K. Bruckner, C. Schreiweis, C. Winter, R. Sohr, L. Becker, V. Wiebe, B. Nickel, T. Giger, U. Muller, M. Groszer, T. Adler, A. Aguilar, I. Bolle, J. Calzada-Wack, C. Dalke, N. Ehrhardt, J. Favor, H. Fuchs, V. Gailus-Durner, W. Hans, G. Holzlwimmer, A. Javaheri, S. Kalaydjiev, M. Kallnik, E. Kling, S. Kunder, I. Mossbrugger, B. Naton, I. Racz, B. Rathkolb, J. Rozman, A. Schrewe, D. H. Busch, J. Graw, B. Ivandic, M. Klingenspor, T. Klopstock, M. Ollert, L. Quintanilla-Martinez, H. Schulz, E. Wolf, W. Wurst, A. Zimmer, S. E. Fisher, R. Morgenstern, T. Arendt, M. H. de Angelis, J. Fischer, J. Schwarz, S. Paabo, Cell 137, 961–971 (2009) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • T. Maricic, V. Gunther, O. Georgiev, S. Gehre, M. Curlin, C. Schreiweis, R. Naumann, H. A. Burbano, M. Meyer, C. Lalueza-Fox, M. de la Rasilla, A. Rosas, S. Gajovic, J. Kelso, W. Enard, W. Schaffner, S. Paabo, Mol Biol Evol 30, 844–852 (2013) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • C. B. Stringer, P. Andrews, Science 239, 1263–1268 (1988) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • C. Stringer, Nature 405, 24–25, 27 (2000) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • R. L. Cann, M. Stoneking, A. C. Wilson, Nature 325, 31–36 (1987) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • F. R. Santos, N. O. Bianchi, S. D. Pena, Genome Res 6, 601–611 (1996) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • R. Thomson, J. K. Pritchard, P. Shen, P. J. Oefner, M. W. Feldman, Proc Natl Acad Sci USA 97, 7360–7365 (2000) [CrossRef] [Google Scholar]
  • M. H. Wolpoff, J. N. Spuhler, F. H. Smith, J. Radovcic, G. Pope, D. W. Frayer, R. Eckhardt, G. Clark, Science 241, 772–774 (1988) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • S. C. Schuster, W. Miller, A. Ratan, L. P. Tomsho, B. Giardine, L. R. Kasson, R. S. Harris, D. C. Petersen, F. Zhao, J. Qi, C. Alkan, J. M. Kidd, Y. Sun, D. I. Drautz, P. Bouffard, D. M. Muzny, J. G. Reid, L. V. Nazareth, Q. Wang, R. Burhans, C. Riemer, N. E. Wittekindt, P. Moorjani, E. A. Tindall, C. G. Danko, W. S. Teo, A. M. Buboltz, Z. Zhang, Q. Ma, A. Oosthuysen, A. W. Steenkamp, H. Oostuisen, P. Venter, J. Gajewski, Y. Zhang, B. F. Pugh, K. D. Makova, A. Nekrutenko, E. R. Mardis, N. Patterson, T. H. Pringle, F. Chiaromonte, J. C. Mullikin, E. E. Eichler, R. C. Hardison, R. A. Gibbs, T. T. Harkins, V. M. Hayes, Nature 463, 943–947 (2010) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • A. Templeton, Nature 416, 45–51 (2002) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • C. Duarte, J. Mauricio, P. B. Pettitt, P. Souto, E. Trinkaus, H. van der Plicht, J. Zilhao, Proc Natl Acad Sci USA 96, 7604–7609 (1999) [CrossRef] [Google Scholar]
  • E. Trinkaus, Proc Natl Acad Sci USA 104, 7367–7372 (2007) [CrossRef] [Google Scholar]
  • S. Sankararaman, S. Mallick, M. Dannemann, K. Prufer, J. Kelso, S. Paabo, N. Patterson, D. Reich, Nature 507, 354–357 (2014) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • S. Sankararaman, N. Patterson, H. Li, S. Paabo, D. Reich, PLoS Genet 8, e1002947 (2012) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • J. D. Wall, M. A. Yang, F. Jay, S. K. Kim, E. Y. Durand, S. Stevison, C. Gignoux, A. Woerner, M. F. Hammer, M. Slatkin, Genetics 194, 199–209 (2013) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • P. Moorjani, N. Patterson, J. N. Hirschhorn, A. Keinan, L. Hao, G. Atzmon, E. Burns, H. Ostrer, A. L. Price, D. Reich, PLoS Genet 7, e1001373 (2011) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • S. A. Tishkoff, F. A. Reed, F. R. Friedlaender, C. Ehret, A. Ranciaro, A. Froment, J. B. Hirbo, A. A. Awomoyi, J. M. Bodo, O. Doumbo, M. Ibrahim, A. T. Juma, M. J. Kotze, G. Lema, J. H. Moore, H. Mortensen, T. B. Nyambo, S. A. Omar, K. Powell, G. S. Pretorius, M. W. Smith, M. A. Thera, C. Wambebe, J. L. Weber, S. M. Williams, Science 324, 1035–1044 (2009) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • B. Vernot, J. M. Akey, Science 343, 1017–1021 (2014) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • P. Skoglund, M. Jakobsson, Proc Natl Acad Sci USA 108, 18301–18306 (2011) [CrossRef] [Google Scholar]
  • M. Currat, L. Excoffier, Proc Natl Acad Sci USA 108, 15129–15134 (2011) [CrossRef] [Google Scholar]
  • Q. Fu, M. Meyer, X. Gao, U. Stenzel, H. A. Burbano, J. Kelso, S. Paabo, Proc Natl Acad Sci USA 110, 2223–2227 (2013) [CrossRef] [Google Scholar]
  • Q. Fu, H. Li, P. Moorjani, F. Jay, S. M. Slepchenko, A. A. Bondarev, P. L. Johnson, A. Aximu-Petri, K. Prufer, C. de Filippo, M. Meyer, N. Zwyns, D. C. Salazar-Garcia, Y. V. Kuzmin, S. G. Keates, P. A. Kosintsev, D. I. Razhev, M. P. Richards, N. V. Peristov, M. Lachmann, K. Douka, T. F. Higham, M. Slatkin, J. J. Hublin, D. Reich, J. Kelso, T. B. Viola, S. Paabo, Nature 514, 445–449 (2014) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • D. Reich, N. Patterson, M. Kircher, F. Delfin, M. R. Nandineni, I. Pugach, A. M. Ko, Y. C. Ko, T. A. Jinam, M. E. Phipps, N. Saitou, A. Wollstein, M. Kayser, S. Paabo, M. Stoneking, Am J Hum Genet 89, 516–528 (2011) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • M. Rasmussen, Y. Li, S. Lindgreen, J. S. Pedersen, A. Albrechtsen, I. Moltke, M. Metspalu, E. Metspalu, T. Kivisild, R. Gupta, M. Bertalan, K. Nielsen, M. T. Gilbert, Y. Wang, M. Raghavan, P. F. Campos, H. M. Kamp, A. S. Wilson, A. Gledhill, S. Tridico, M. Bunce, E. D. Lorenzen, J. Binladen, X. Guo, J. Zhao, X. Zhang, H. Zhang, Z. Li, M. Chen, L. Orlando, K. Kristiansen, M. Bak, N. Tommerup, C. Bendixen, T. L. Pierre, B. Gronnow, M. Meldgaard, C. Andreasen, S. A. Fedorova, L. P. Osipova, T. F. Higham, C. B. Ramsey, T. V. Hansen, F. C. Nielsen, M. H. Crawford, S. Brunak, T. Sicheritz-Ponten, R. Villems, R. Nielsen, A. Krogh, J. Wang, E. Willerslev, Nature 463, 757–762 (2010) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • L. Abi-Rached, M. J. Jobin, S. Kulkarni, A. McWhinnie, K. Dalva, L. Gragert, F. Babrzadeh, B. Gharizadeh, M. Luo, F. A. Plummer, J. Kimani, M. Carrington, D. Middleton, R. Rajalingam, M. Beksac, S. G. Marsh, M. Maiers, L. A. Guethlein, S. Tavoularis, A. M. Little, R. E. Green, P. J. Norman, P. Parham, Science 334, 89–94 (2011) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • E. Huerta-Sanchez, X. Jin, Asan, Z. Bianba, B. M. Peter, N. Vinckenbosch, Y. Liang, X. Yi, M. He, M. Somel, P. Ni, B. Wang, X. Ou, Huasang, J. Luosang, Z. X. Cuo, K. Li, G. Gao, Y. Yin, W. Wang, X. Zhang, X. Xu, H. Yang, Y. Li, J. Wang, R. Nielsen, Nature 512, 194–197 (2014) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • S. T. D. Consortium, A. L. Williams, S. B. Jacobs, H. Moreno-Macias, A. Huerta-Chagoya, C. Churchhouse, C. Marquez-Luna, H. Garcia-Ortiz, M. J. Gomez-Vazquez, N. P. Burtt, C. A. Aguilar-Salinas, C. Gonzalez-Villalpando, J. C. Florez, L. Orozco, C. A. Haiman, T. Tusie-Luna, D. Altshuler, Nature 506, 97–101 (2014) [PubMed] [Google Scholar]
  • F. L. Mendez, T. Krahn, B. Schrack, A. M. Krahn, K. R. Veeramah, A. E. Woerner, F. L. Fomine, N. Bradman, M. G. Thomas, T. M. Karafet, M. F. Hammer, Am J Hum Genet 92, 454–459 (2013) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • E. Elhaik, T. V. Tatarinova, A. A. Klyosov, D. Graur, Eur J Hum Genet (2014) [Google Scholar]
  • K. Harvati, C. Stringer, R. Grun, M. Aubert, P. Allsworth-Jones, C. A. Folorunso, PLoS one 6, e24024 (2011) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • J. Lachance, B. Vernot, C. C. Elbers, B. Ferwerda, A. Froment, J. M. Bodo, G. Lema, W. Fu, T. B. Nyambo, T. R. Rebbeck, K. Zhang, J. M. Akey, S. A. Tishkoff, Cell 150, 457–469 (2012) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • M. Meyer, Q. Fu, A. Aximu-Petri, I. Glocke, B. Nickel, J. L. Arsuaga, I. Martinez, A. Gracia, J. M. de Castro, E. Carbonell, S. Paabo, Nature 505, 403–406 (2014) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • A. R. Wallace, Transactions of the Linnean Society of London 25, 1–71 (1865) [CrossRef] [Google Scholar]
  • E. Mayr, Science 141, 765 (1963) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]
  • K. de Queiroz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 Suppl 1, 6600–6607 (2005) [CrossRef] [Google Scholar]
  • K. de Queiroz, Syst. Biol. 56, 879–886 (2007) [CrossRef] [PubMed] [Google Scholar]

Current usage metrics show cumulative count of Article Views (full-text article views including HTML views, PDF and ePub downloads, according to the available data) and Abstracts Views on Vision4Press platform.

Data correspond to usage on the plateform after 2015. The current usage metrics is available 48-96 hours after online publication and is updated daily on week days.

Initial download of the metrics may take a while.